Según el Centro para el control de Enfermedades de Estados Unidos asegura que el gel desinfectante sólo debe utilizarse como suplemento del agua y el jabón pero nunca como sustituto.
El gel no tiene la capacidad de limpiar las manos, sólo puede matar microbios que están en la superficie. A medida que la mugre aumenta en la mano su efectividad disminuye.
Sin embargo una investigación de la Universidad de Michigan reveló que uno de sus componentes, el triclosán, no tiene beneficios antibacterianos y que no es tan efectivo para minimizar infecciones virales como la influenza.
